跑步3000公里和步行3000公里的区别在于锻炼方法和效果。跑步比步行需要更多的耐力和毅力，尤其是长跑。长跑需要长时间的持续努力和毅力，对身体和意志都是巨大的挑战。因此，跑步三千公里可以更好地培养耐力和毅力，可以提高个人的自律性和毅力。